289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1809 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  9e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  71.61 
 
 		 155 aa  245  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  58.71 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  53.25 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  42.58 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  40.65 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  35.26 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  41.29 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  39.07 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  31.61 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  41.45 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  34.42 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  35.19 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  30.32 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  34.64 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  39.87 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  29.03 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  34.81 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  34.59 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  39.47 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  39.47 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  34.81 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  42.04 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  30.77 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  32.69 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  41.06 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  35.62 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  34.39 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  39.74 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  29.94 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.53 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  37.18 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  36.94 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 177 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  30.52 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  32.48 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  29.41 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  34.42 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  37.96 
 
 		 194 aa  92.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  37.33 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  34.87 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  28.03 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  51.14 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  38.82 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  34.19 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  36.36 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  43.62 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  28.85 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  33.96 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  32.47 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  36.6 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  32.69 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  37.11 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  39.47 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  36.71 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  33.55 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>