More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3017 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 360 aa  731    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  59.88 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  45.82 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 364 aa  85.9  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.22 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  26.64 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  29.11 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  23.39 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  27.39 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  43.75 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.87 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.89 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  33.9 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  22.95 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  33.05 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.05 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  36.27 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  37.25 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  23.39 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 		 384 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  32.2 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  32.6 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  39.81 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  35.71 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.97 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  25.79 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0662  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0132894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05650  glycosyltransferase  39.25 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.520529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.06 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  30.07 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13801  hypothetical protein  34.21 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.8447  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  40.95 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  32.96 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  35.51 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.85 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  33.93 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>