More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2995 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2995  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  506  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  78.67 
 
 
233 aa  358  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1367  ATPase  70.4 
 
 
231 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  62.78 
 
 
228 aa  288  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  63.8 
 
 
225 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2232  ABC transporter related  62.73 
 
 
229 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  57.82 
 
 
275 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.97 
 
 
233 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  55.25 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.47 
 
 
234 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
234 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
234 aa  228  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.88 
 
 
235 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.77 
 
 
235 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  51.61 
 
 
230 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  54.03 
 
 
223 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.35 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 
239 aa  224  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  51.75 
 
 
246 aa  224  9e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
231 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  55.92 
 
 
227 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  51.14 
 
 
229 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
253 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 
225 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
238 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
224 aa  221  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.05 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  49.32 
 
 
224 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  52.05 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  52.05 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.05 
 
 
233 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.24 
 
 
227 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 
233 aa  218  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 
233 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 
233 aa  218  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.65 
 
 
318 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 
233 aa  218  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.65 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  48.66 
 
 
238 aa  218  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  51.6 
 
 
230 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.7 
 
 
225 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.25 
 
 
224 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
233 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 
231 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.68 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  55.76 
 
 
244 aa  215  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  48.89 
 
 
233 aa  214  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.89 
 
 
233 aa  214  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.21 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  52.49 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.12 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.12 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.57 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.03 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.79 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  50.23 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  50.47 
 
 
227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.25 
 
 
242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.33 
 
 
227 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.92 
 
 
242 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.34 
 
 
238 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.91 
 
 
230 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  50.47 
 
 
242 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  52.17 
 
 
224 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.17 
 
 
227 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.66 
 
 
226 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.27 
 
 
225 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.64 
 
 
228 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.22 
 
 
249 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
244 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.44 
 
 
249 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.66 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
240 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  49.06 
 
 
227 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  51.13 
 
 
687 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 
240 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.61 
 
 
247 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.43 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.7 
 
 
227 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
240 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.78 
 
 
249 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  53.57 
 
 
237 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>