More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1847 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  67.1 
 
 		 647 aa  778    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 609 aa  1230    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  64.53 
 
 		 616 aa  768    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  99.18 
 
 		 609 aa  1218    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.56 
 
 		 614 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 		 645 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  49.33 
 
 		 620 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  46.06 
 
 		 602 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  45.41 
 
 		 601 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  44.25 
 
 		 663 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  45.48 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  45.65 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  45.08 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 612 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 633 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.94 
 
 		 610 aa  334  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 592 aa  326  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 612 aa  325  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 603 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 610 aa  317  6e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 603 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 607 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 610 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.39 
 
 		 610 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 610 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.11 
 
 		 601 aa  300  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 609 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 616 aa  296  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 605 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 604 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 601 aa  291  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  31.41 
 
 		 611 aa  289  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  31.89 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.59 
 
 		 602 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 		 602 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  31.78 
 
 		 588 aa  286  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 594 aa  286  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 591 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 604 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  33.28 
 
 		 580 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 580 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 669 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 601 aa  281  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 630 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  33.82 
 
 		 597 aa  280  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.09 
 
 		 587 aa  279  8e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 637 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 597 aa  279  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 599 aa  279  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 660 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 590 aa  276  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 652 aa  275  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 601 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 660 aa  273  6e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 605 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 597 aa  270  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 672 aa  270  8e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 597 aa  270  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.36 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 609 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 622 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.96 
 
 		 599 aa  268  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 597 aa  267  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 601 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 600 aa  266  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 597 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 597 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 612 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 601 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 601 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 590 aa  264  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 601 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 685 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 597 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 593 aa  263  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 649 aa  263  8e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 623 aa  263  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 597 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 601 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 605 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 606 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 597 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 598 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.73 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 600 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 595 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 618 aa  260  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 606 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>