110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1519 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0921  Tn916, transcriptional regulator, putative  45.31 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 503 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0282  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0320229  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  42.31 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  24.19 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  35 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  35 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  28.77 
 
 		 376 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  40.85 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  35 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  36.07 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2143  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 80 aa  42  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  35 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 424 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1596  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.46 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000735944  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 345 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1778  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 88 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 64 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 69 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 474 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0878  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 79 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3888  hypothetical protein  37.7 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000176936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 175 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  28.75 
 
 		 488 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2204  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  53.33 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  30.14 
 
 		 399 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  33.75 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4017  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 464 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2109  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  33.75 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0640  transcriptional regulator, XRE family  25.35 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  28.95 
 
 		 213 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 175 aa  40  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>