180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1499 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
703 aa  1452    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  51.85 
 
 
719 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  55.61 
 
 
719 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.36 
 
 
539 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.36 
 
 
539 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  35.89 
 
 
365 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  35.74 
 
 
490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.51 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  35.34 
 
 
487 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
389 aa  127  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  32.48 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  33.77 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  31.46 
 
 
535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  32.81 
 
 
486 aa  115  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
427 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
483 aa  97.4  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  29.37 
 
 
315 aa  92  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  49.07 
 
 
283 aa  90.1  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
490 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
350 aa  84  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.8 
 
 
328 aa  84  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  24.7 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.07 
 
 
406 aa  83.2  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
311 aa  82  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.67 
 
 
350 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.65 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  24.62 
 
 
313 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.37 
 
 
451 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
335 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.91 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  24.62 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  26 
 
 
327 aa  73.2  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
465 aa  72  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
385 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
385 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  28.91 
 
 
318 aa  72  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  21.72 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
310 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  24.74 
 
 
324 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  24.74 
 
 
413 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  24.29 
 
 
313 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.61 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.05 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  29.45 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.98 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 
380 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 
379 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
390 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
335 aa  66.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  41.84 
 
 
387 aa  66.6  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
390 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  23.59 
 
 
323 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 
444 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  32.24 
 
 
239 aa  65.1  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  30.97 
 
 
657 aa  65.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 
328 aa  65.1  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 
418 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3372  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.85 
 
 
502 aa  64.7  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 
418 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  26.26 
 
 
383 aa  63.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25.25 
 
 
320 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 
446 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  25.12 
 
 
305 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
334 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
368 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  26.83 
 
 
460 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.29 
 
 
382 aa  63.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.12 
 
 
539 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  26.83 
 
 
460 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.47 
 
 
424 aa  62.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  31.13 
 
 
456 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  31.13 
 
 
456 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  29.56 
 
 
373 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3182  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.12 
 
 
495 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
416 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.29 
 
 
350 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  23.11 
 
 
350 aa  61.6  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
487 aa  61.6  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  25.98 
 
 
423 aa  60.1  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.07 
 
 
357 aa  60.1  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4397  modification methylase ScrFIB  26.88 
 
 
324 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  24.15 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
236 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 
283 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  25.49 
 
 
423 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 
421 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
370 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2140  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.54 
 
 
316 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199613  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 
395 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.15 
 
 
331 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
423 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
372 aa  58.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
389 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  26.82 
 
 
778 aa  58.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  24.5 
 
 
373 aa  58.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>