48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1327 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  100 
 
 
375 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  28.14 
 
 
471 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.83 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  25.24 
 
 
441 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 
435 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 
440 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  26.2 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  21.77 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.89 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
287 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 
453 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  28.45 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  24.32 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
496 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.92 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.46 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  24.32 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.42 
 
 
479 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  25.77 
 
 
769 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  26.72 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 
359 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 
452 aa  43.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.69 
 
 
397 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>