More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0804 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  60 
 
 
211 aa  251  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  54.04 
 
 
213 aa  221  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  51.53 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.72 
 
 
214 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  53.81 
 
 
208 aa  207  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  52.04 
 
 
215 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  53.06 
 
 
213 aa  204  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.27 
 
 
233 aa  204  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  50.24 
 
 
217 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  51.21 
 
 
214 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.55 
 
 
229 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  53.06 
 
 
211 aa  202  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  52 
 
 
207 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  48.31 
 
 
220 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  51.78 
 
 
212 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.5 
 
 
211 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  50 
 
 
214 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  50.5 
 
 
214 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.51 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  51.02 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.51 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  51.27 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  49.75 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  49.49 
 
 
214 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  51.53 
 
 
212 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  50.51 
 
 
213 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  51.53 
 
 
210 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  46.7 
 
 
228 aa  199  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  49.51 
 
 
210 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  50.51 
 
 
213 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  47.29 
 
 
218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  49.74 
 
 
215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  46.8 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  49.28 
 
 
213 aa  198  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  51.53 
 
 
212 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 
213 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  49.49 
 
 
213 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  49.75 
 
 
215 aa  197  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  49.51 
 
 
212 aa  197  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  49.51 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  50 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  51.53 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.02 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  50 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.02 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  48.72 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  49.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.29 
 
 
218 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  51.02 
 
 
335 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  51.53 
 
 
212 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  51.53 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  48.21 
 
 
215 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  50 
 
 
213 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.53 
 
 
231 aa  194  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  49.49 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  48.5 
 
 
210 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  47.96 
 
 
218 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  47.96 
 
 
218 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  48 
 
 
209 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  48 
 
 
211 aa  193  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  48.98 
 
 
212 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  50.26 
 
 
223 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  51.02 
 
 
211 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  48.5 
 
 
211 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  50 
 
 
214 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  48.31 
 
 
211 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  48 
 
 
209 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  50.99 
 
 
213 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  48.47 
 
 
248 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.28 
 
 
214 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.52 
 
 
214 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  48.47 
 
 
260 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  49 
 
 
217 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  48.99 
 
 
260 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  47.44 
 
 
234 aa  192  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  46.77 
 
 
219 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  47.57 
 
 
219 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.57 
 
 
219 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  49.52 
 
 
214 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  48.31 
 
 
213 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  49.49 
 
 
211 aa  191  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.04 
 
 
212 aa  191  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  46.97 
 
 
236 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  50.26 
 
 
223 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  46.08 
 
 
226 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>