64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0619 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
373 aa  765    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  43.41 
 
 
390 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  31.16 
 
 
407 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  22.07 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.69 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  22.96 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.55 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.54 
 
 
445 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  21.17 
 
 
1682 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  23.5 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.24 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  24.91 
 
 
1454 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  22.02 
 
 
603 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  22.36 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  22.65 
 
 
2122 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.13 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 
687 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  20 
 
 
440 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.58 
 
 
1812 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  21.6 
 
 
603 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  23.85 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  25 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.96 
 
 
457 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  23.42 
 
 
475 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  21.65 
 
 
611 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  21.31 
 
 
619 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  21.52 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3410  Pyrrolo-quinoline quinone  22.89 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  26.83 
 
 
469 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  22.86 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  23.1 
 
 
1328 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.01 
 
 
652 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0886  WD40-like protein  29.17 
 
 
433 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000134516  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  20.33 
 
 
795 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  22.99 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.46 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  24.46 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  20.3 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  22.58 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  22.91 
 
 
901 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  22.63 
 
 
1241 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  21.88 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.05 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  22.88 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24 
 
 
774 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  20 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.14 
 
 
797 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.1 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  23.69 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  23.74 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  23.74 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  28.44 
 
 
1067 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  23.74 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.74 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  23.74 
 
 
381 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  23.74 
 
 
381 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  23.74 
 
 
381 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.74 
 
 
350 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  23.74 
 
 
381 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>