More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3025 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  53.81 
 
 		 228 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  53.36 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  53.36 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  51.64 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  49.7 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  58.7 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  43.29 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  38.65 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  44.87 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  48.05 
 
 		 209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  43.07 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  42.13 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  45.99 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  42.25 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.9 
 
 		 226 aa  121  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.09 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.7 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.36 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  44.53 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  44.53 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  44.53 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.53 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  38.07 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  38.07 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  38.86 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  38.86 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  43.88 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  38.86 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  38.86 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  43.57 
 
 		 243 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  43.57 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  34.95 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  43.88 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  41.61 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.47 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.14 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  41.59 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.25 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  42.07 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  42.76 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  41.43 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.07 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.07 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.07 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  45.91 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.07 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.5 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  45.91 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.07 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  36.51 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40.26 
 
 		 233 aa  111  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  46.02 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  39.88 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  40.88 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.02 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.64 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  33.04 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  46.02 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  40.88 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  40.88 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  40.88 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  42.38 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  42.14 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.03 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  38.43 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  39.86 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  46.38 
 
 		 286 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  41.05 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  40.12 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.49 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.1 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  40 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.85 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  38.41 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  40.71 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  38.99 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  38.99 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>