256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2005 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2005  putative cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 451 aa  901    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  61.23 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  46.54 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  45.37 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  44.85 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  43.45 
 
 		 498 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0540  di-haem cytochrome c peroxidase  32.62 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  30.93 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  30.6 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  29.02 
 
 		 768 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  30.32 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  29.8 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  30.15 
 
 		 346 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  29.38 
 
 		 358 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  29.97 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  31.46 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  29.77 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.71 
 
 		 334 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  29.95 
 
 		 357 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.36 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  29.48 
 
 		 346 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  28.83 
 
 		 345 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.68 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  29.46 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  30.54 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  28.14 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  28.46 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  30.4 
 
 		 347 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  30.4 
 
 		 347 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  29.12 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  29.12 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  29.12 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  27.36 
 
 		 379 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.35 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  29.04 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  28.43 
 
 		 352 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  27.33 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  27.63 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  27.25 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  27.63 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  27.63 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  25.5 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  30.09 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  27.01 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  31.23 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  31.23 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.23 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  26.76 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  31.23 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  27.3 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  27.68 
 
 		 314 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  26.93 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.23 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.23 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  31.23 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  29.81 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 348 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  27.63 
 
 		 343 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  27.78 
 
 		 339 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  25.61 
 
 		 304 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  26.37 
 
 		 306 aa  100  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  27.74 
 
 		 521 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.41 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  25.61 
 
 		 304 aa  99.8  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  30.55 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  25.17 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  26.83 
 
 		 626 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.82 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  30.48 
 
 		 340 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  27.86 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  28.18 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  27.63 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  27.67 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  31.63 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.74 
 
 		 594 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  26.95 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  31.31 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 399 aa  97.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  28.64 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 		 330 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.72 
 
 		 626 aa  97.1  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  31.31 
 
 		 466 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  31.31 
 
 		 466 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  31.31 
 
 		 466 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  29.48 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  27.16 
 
 		 353 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  28.89 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  28.22 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  27.19 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  26.81 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  24.2 
 
 		 330 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>