93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0327 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  100 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  44.53 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  44.76 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  47.58 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  47.58 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  46.77 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  40.48 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  36.33 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  36.82 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  35.83 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  33.74 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  34.16 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  33.07 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  35.02 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  33.73 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  34.68 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.98 
 
 		 587 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  34.63 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  34.36 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  32 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  33.86 
 
 		 292 aa  121  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  32.68 
 
 		 264 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  35.66 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  33.59 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  33.2 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  37.21 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  31.45 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  34.52 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  31.75 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  29.89 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  33.46 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  30.32 
 
 		 312 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  26.98 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  27.4 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  27.76 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  26.79 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  27.76 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  29.33 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  25.45 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  25.91 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  25.91 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  28.26 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  25.35 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  32.76 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  25.83 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  23.01 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  25.46 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  23.01 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  25.83 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3506  MOSC domain protein beta barrel domain protein  26.8 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.28145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  29.96 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  23.27 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2173  MOSC domain containing protein  26.29 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.470519  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  29.66 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  29.66 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  29.66 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  25.35 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  29.66 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  29.66 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  29.66 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  27.24 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  29.66 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  29.66 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  25.18 
 
 		 371 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  29.49 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  29.49 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  31.36 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  25.78 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  31.16 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  29.49 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  28.85 
 
 		 369 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  26.05 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  25.42 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  33.04 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  29.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  28.29 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  25.26 
 
 		 616 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  27.48 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  27.48 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  24.2 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  29.06 
 
 		 367 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  29.91 
 
 		 367 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  27.97 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  26.8 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  27.48 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  27.08 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  57.89 
 
 		 347 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  40.38 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  24.73 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  28.81 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  30.21 
 
 		 367 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  32.35 
 
 		 259 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>