120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2530 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  353  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  68.64 
 
 		 168 aa  258  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  59.26 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  47.77 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  40.78 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  46.62 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  40.24 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  35 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  41.33 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  37.82 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  37.23 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  37.91 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.31 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  33.79 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  39.45 
 
 		 209 aa  87.8  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  30.2 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  30.2 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.46 
 
 		 195 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.42 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  33.08 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.91 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.75 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  30.57 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.62 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.38 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.54 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  36.44 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  35.85 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  31.47 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  37.14 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.98 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  35.92 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.05 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.52 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  34.02 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  25.93 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  36.19 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  32.31 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.88 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  31.67 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.25 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  28.83 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.17 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  24.79 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.21 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  24.48 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.93 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.54 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  31.93 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.97 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  38 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  28.91 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  25.42 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  29.23 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.06 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.44 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  33 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.84 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.84 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  26.76 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 216 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  26.76 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 180 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.87 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  38.81 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.49 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.48 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.69 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  36.51 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.98 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  27.87 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  27.87 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>