183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2432 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2432  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 535 aa  1113    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1480  radical SAM domain-containing protein  36.22 
 
 		 585 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1873  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 697 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0202  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.92 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  23.85 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  26.29 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.62 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 531 aa  63.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  24.73 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  25.34 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.65 
 
 		 864 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 547 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 469 aa  62  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.83 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.76 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 468 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  24.06 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.72 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.74 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.72 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 723 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.09 
 
 		 567 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  22.83 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 471 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 521 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 494 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  26.28 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 503 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.74 
 
 		 565 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 522 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 469 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 520 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 554 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  25.89 
 
 		 487 aa  55.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 476 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 543 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 472 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 527 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  22.45 
 
 		 501 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 429 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 520 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 472 aa  54.3  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  27.43 
 
 		 494 aa  53.9  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  27.43 
 
 		 494 aa  54.3  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.35 
 
 		 612 aa  53.9  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  26.8 
 
 		 523 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.35 
 
 		 569 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  23.7 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 534 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 600 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0204  radical SAM domain-containing protein  20.93 
 
 		 452 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  24.4 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 681 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  26.6 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.4 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 467 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.27 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.4 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  25.5 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 468 aa  51.6  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>