204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0696 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
130 aa  250  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  36.79 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  43.55 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  49.06 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  55.36 
 
 
60 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  46.3 
 
 
83 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.96 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  41.03 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  45.16 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  47.46 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  44.07 
 
 
60 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 
60 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  43.1 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  52.54 
 
 
61 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
59 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  49.12 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  49.15 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  39.22 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  43.28 
 
 
135 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  43.86 
 
 
80 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  44.83 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  27.78 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  43.28 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.33 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2787  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  45.1 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  38.33 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  38.33 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.83 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  33.78 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  29.03 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  45.9 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
63 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 
63 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  40.74 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  40.74 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 
123 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.82 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  34.25 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>