More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0236 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0236  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 401 aa  813    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0928  DNA-directed DNA polymerase  34.11 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0500  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.73 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0517  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  31.41 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  29.04 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  29.84 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  29.72 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  31.27 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.01 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  28.21 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 481 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  27.44 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  29.84 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  27.91 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  29.5 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  34.83 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  30 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  26.91 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  26.61 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  26.94 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  30.75 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1740  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.9 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  29.72 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  27.34 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  27.64 
 
 		 380 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  29.46 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  28.82 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  27.23 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  29.59 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  27.84 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  28.68 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  26.96 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  29.6 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  27.55 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  32.04 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  30.9 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  30.69 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  32.83 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  27.15 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  29.41 
 
 		 413 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  27.37 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  30.69 
 
 		 425 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  33.13 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  32.96 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  31.11 
 
 		 407 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3175  DNA-directed DNA polymerase  27.01 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  27.13 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  31.23 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.09 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  29.87 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  25.77 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  30.87 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  28.8 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  30.81 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  29.09 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  29.09 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  28.21 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  29.12 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  29.54 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  29.95 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  28.64 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  31.06 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  28.24 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  30.1 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  27.51 
 
 		 385 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.55 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  27.48 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  30.18 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  31.33 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  32 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  31.25 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  31.25 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  27.48 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  30.18 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  32.73 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  31.25 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  26.48 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  31.18 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  28.83 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  29.93 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  32.5 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  23.46 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  28.72 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  32.01 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  25.69 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  29.06 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  30.82 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  28.68 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  28.42 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  28.44 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  28.44 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  32.17 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  27.41 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  30.05 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  27.27 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>