More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1394 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1394  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0316  DNA-binding response regulator  93.3 
 
 		 225 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_106  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0274  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1330  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0304  response regulator  37.67 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1540  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_85  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_86  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1311  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1432  DNA-binding response regulator  38.77 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0106  two component transcriptional regulator  43.27 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0124  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0300  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 225 aa  148  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1355  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  34.36 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  34.36 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  34.75 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  34.75 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 247 aa  131  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.29 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  32.61 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  32.88 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  32.88 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  32.03 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  32.88 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  32.88 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  34.84 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  32.88 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  32.88 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.02 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  32.88 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  32.88 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  32.03 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  32.03 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  32.03 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  32.03 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  32.03 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  32.03 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>