More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3296 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  63.47 
 
 
308 aa  296  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  65.74 
 
 
340 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  62.84 
 
 
305 aa  291  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  63.76 
 
 
309 aa  291  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.81 
 
 
302 aa  290  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  60.34 
 
 
302 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  63.76 
 
 
309 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  59.59 
 
 
302 aa  289  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  62.1 
 
 
308 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  61.29 
 
 
309 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  61.29 
 
 
306 aa  284  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  59.82 
 
 
302 aa  283  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  61.82 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  61.82 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  61.82 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  61.11 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  62.04 
 
 
297 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  62.04 
 
 
311 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  57.99 
 
 
298 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  61.01 
 
 
300 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  60.55 
 
 
298 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 
307 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  60.83 
 
 
316 aa  275  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  58.72 
 
 
300 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  58.64 
 
 
301 aa  271  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  57.01 
 
 
306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  62.67 
 
 
308 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  57.34 
 
 
302 aa  264  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  55.86 
 
 
306 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.08 
 
 
337 aa  261  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  58.26 
 
 
312 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.41 
 
 
317 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  59.26 
 
 
299 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.22 
 
 
312 aa  258  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  57.47 
 
 
328 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.36 
 
 
302 aa  251  9.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  56.02 
 
 
317 aa  248  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  56.48 
 
 
300 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.18 
 
 
324 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  52.07 
 
 
307 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  52.07 
 
 
307 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  51.61 
 
 
307 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
304 aa  221  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  41.67 
 
 
300 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  44.18 
 
 
390 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
304 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.56 
 
 
279 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  40.65 
 
 
305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  42.79 
 
 
307 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  40.81 
 
 
313 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
304 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  42.52 
 
 
303 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
327 aa  175  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  40.52 
 
 
250 aa  175  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  40.52 
 
 
250 aa  175  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  37.56 
 
 
290 aa  174  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  41.44 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  38.25 
 
 
297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  39.91 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
314 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  41.05 
 
 
334 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  40.09 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
256 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.53 
 
 
309 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
297 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  38 
 
 
266 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
310 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  42.73 
 
 
316 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  36.99 
 
 
297 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  42.53 
 
 
293 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
297 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  38.39 
 
 
339 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  36.74 
 
 
291 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.29 
 
 
328 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.04 
 
 
332 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.08 
 
 
326 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  38.01 
 
 
309 aa  158  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.16 
 
 
316 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
305 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  40.27 
 
 
331 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 
259 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
310 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.32 
 
 
247 aa  156  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
312 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
312 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.61 
 
 
337 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>