182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2278 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  100 
 
 		 464 aa  967    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  34.54 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  33.33 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  31.13 
 
 		 452 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  29.41 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  29.72 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  31.05 
 
 		 459 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  29.09 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  30.04 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  30.04 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  30.91 
 
 		 532 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  29.54 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  29.66 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  30.15 
 
 		 454 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  30.43 
 
 		 457 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  29.64 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  28.34 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  29.19 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  28.48 
 
 		 487 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  29.88 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.49 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  29.06 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  30.38 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  27.98 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.47 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  29.35 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  29.18 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  29.18 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  30.15 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  26.58 
 
 		 469 aa  153  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  29.51 
 
 		 493 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  29.51 
 
 		 493 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  27.89 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  28.48 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  27.58 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.23 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.9 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  26.5 
 
 		 444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  25.3 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  25.1 
 
 		 512 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.62 
 
 		 445 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  22.9 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.12 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.02 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.02 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.02 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.02 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.48 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.39 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.29 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.59 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.44 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  23.23 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.59 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  21.76 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.8 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  22.77 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  21.89 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  23.37 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.41 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  22.55 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  26.33 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  22.18 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  21.29 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  23.96 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  21.12 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  25.21 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  24.22 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  35.24 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  22.56 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  25.51 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  35.42 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  23.64 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.06 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  20.5 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  22.87 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  23.05 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.49 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  26.49 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.49 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  34.26 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  34.26 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4436  amine oxidase  22.49 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  31.73 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  22.86 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  22.13 
 
 		 473 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.27 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  23.01 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  26.89 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  42.62 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>