More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2316 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  61.94 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  57.78 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  54.81 
 
 		 132 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  51.88 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  43.38 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  53.44 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  51.88 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  49.61 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  44.7 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  51.88 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  44.7 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  47.66 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  51.85 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  51.97 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  50.76 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  42.54 
 
 		 131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  51.16 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  48.12 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  41.35 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  46.27 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  40.6 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  44.36 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  39.1 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  46.62 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  41.98 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  41.79 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  45.11 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  44.36 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  48.78 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  47.41 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  47.76 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  49.17 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  45.11 
 
 		 133 aa  120  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  42.96 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  47.76 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  37.23 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  45.11 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  44.6 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  43.61 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  41.98 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  41.98 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  42.11 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  44.62 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  38.52 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  41.98 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  42.65 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  45.93 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  42.42 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  43.18 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  35.94 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  46.73 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  41.41 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  36.3 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  45.79 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  43.93 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  40.15 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  51.72 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  34.35 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  51.72 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  52.87 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  39.68 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  51.72 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  54.44 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  49.43 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  48.48 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  40.15 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  46.36 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  45.98 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  43.55 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  41.27 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  40.65 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  47.83 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  36.5 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  51.14 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  39.52 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  48.31 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  49.44 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  36.43 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.71 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  53.93 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  38.84 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  46.39 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  44.94 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  45 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  43.52 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  39.17 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  33.82 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  41.41 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  36.76 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  34.31 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>