288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2291 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  324  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  60.65 
 
 		 155 aa  203  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  58.71 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  53.9 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  44.52 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  40.65 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  38.06 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  37.66 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  37.01 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  37.25 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  41.06 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  32.47 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  38.04 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  32.92 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.09 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  33.74 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35.9 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  36.77 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  35.95 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  35.29 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  34.18 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  32.05 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  32.69 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  38.82 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  38.89 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  33.99 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  34.64 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  38.41 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  34.64 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  30.38 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  38.41 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  35.67 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  32.08 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  29.94 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  34.31 
 
 		 194 aa  91.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  29.94 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  30.07 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.85 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  38.16 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  38.06 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  29.94 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  33.12 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  48.84 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  31.06 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1236  protein of unknown function DUF163  33.56 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0319909  normal  0.195697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  39.1 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  32.47 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  35.53 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  37.09 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  33.75 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  39.75 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  34.21 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  29.94 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  31.45 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  37.58 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  34.87 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>