More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1824 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  72.31 
 
 		 198 aa  265  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  65.15 
 
 		 199 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  55.78 
 
 		 199 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  59.69 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  65.98 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  58.79 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  51.52 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  51.27 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  45 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  47.87 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  41.92 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  42.08 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  43.07 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  43.07 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  43.81 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  38.69 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  36.44 
 
 		 262 aa  137  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  42.93 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  40.3 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  38.07 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  38.12 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  37.88 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  36.82 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  40.41 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  40.41 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  37.11 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  33.48 
 
 		 259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  39.18 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.97 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  41.18 
 
 		 832 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  35.5 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  33.84 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.93 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  36.92 
 
 		 819 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  36.27 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  34.74 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  38.02 
 
 		 825 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  29.02 
 
 		 243 aa  98.2  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  31.96 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  31.72 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.02 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.8 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.66 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.68 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  31.31 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  30.98 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  30.27 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  31.79 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  31.35 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.98 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  30.98 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.98 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  32.81 
 
 		 827 aa  88.6  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.84 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.43 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.43 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  32.8 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  30.3 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  32.07 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  31.47 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  30.69 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.85 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  29.8 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  32.28 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 		 208 aa  84.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  28.65 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  39.29 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  31.34 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  28.85 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  31.18 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  32.29 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.82 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  32.29 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.29 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  28.29 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  31.25 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  29.76 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  31.34 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.8 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>