More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0682 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 731 aa  1515    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  59.56 
 
 		 729 aa  871    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  36.35 
 
 		 807 aa  476  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  35.92 
 
 		 730 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  36.15 
 
 		 731 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  37.39 
 
 		 695 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 764 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  35.43 
 
 		 759 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  35.7 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  37.58 
 
 		 722 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  36.05 
 
 		 738 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  35.9 
 
 		 737 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  33.03 
 
 		 760 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  35.41 
 
 		 739 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 		 764 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  32.99 
 
 		 764 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 		 739 aa  375  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 		 764 aa  376  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  33.9 
 
 		 760 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  32.4 
 
 		 761 aa  373  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  32.73 
 
 		 760 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  35.75 
 
 		 744 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  34.45 
 
 		 760 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  32.22 
 
 		 764 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  32.25 
 
 		 764 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 		 758 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  34.18 
 
 		 747 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  31.59 
 
 		 757 aa  364  3e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  35.48 
 
 		 698 aa  361  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  34.01 
 
 		 695 aa  360  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  34.51 
 
 		 750 aa  360  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  32.57 
 
 		 754 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  31.81 
 
 		 760 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  32.56 
 
 		 731 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  33.62 
 
 		 700 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  32.62 
 
 		 720 aa  346  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  31.08 
 
 		 758 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 		 741 aa  345  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  31.08 
 
 		 758 aa  343  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  30.95 
 
 		 758 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  30.82 
 
 		 758 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  30.82 
 
 		 758 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 		 760 aa  342  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  34.13 
 
 		 704 aa  339  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  31.85 
 
 		 756 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  32.35 
 
 		 708 aa  336  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 		 738 aa  335  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  31.98 
 
 		 733 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 		 739 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  30.87 
 
 		 731 aa  325  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 		 731 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.46 
 
 		 734 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.84 
 
 		 732 aa  275  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 		 729 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  29.72 
 
 		 745 aa  264  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 		 879 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  32.05 
 
 		 936 aa  257  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  31.14 
 
 		 739 aa  257  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 		 747 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  27.66 
 
 		 879 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 		 698 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  29.06 
 
 		 700 aa  238  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 726 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.03 
 
 		 766 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29.52 
 
 		 820 aa  230  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 711 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  29.22 
 
 		 891 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  30.07 
 
 		 711 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.76 
 
 		 781 aa  226  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  29.79 
 
 		 709 aa  225  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 		 731 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.63 
 
 		 685 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 		 1055 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  25.82 
 
 		 669 aa  218  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.69 
 
 		 792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.69 
 
 		 792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.69 
 
 		 792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  28.63 
 
 		 711 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  29.76 
 
 		 688 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.69 
 
 		 792 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 777 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 		 812 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  26.71 
 
 		 799 aa  213  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.49 
 
 		 792 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  26.2 
 
 		 807 aa  211  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.2 
 
 		 807 aa  211  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.2 
 
 		 807 aa  211  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.36 
 
 		 798 aa  211  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  26.2 
 
 		 807 aa  211  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.24 
 
 		 811 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.36 
 
 		 798 aa  210  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  28.02 
 
 		 776 aa  210  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.08 
 
 		 807 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.12 
 
 		 685 aa  209  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.12 
 
 		 811 aa  210  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.12 
 
 		 811 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  27.17 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 		 694 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 		 732 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.12 
 
 		 811 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>