More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3295 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 222 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  64.59 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  64.59 
 
 		 249 aa  274  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 224 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  60.29 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  57.75 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  60.89 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  49.27 
 
 		 245 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  46.53 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  42.51 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  43.15 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  37.98 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  32.69 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  35.95 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 267 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.53 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 265 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 396 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.53 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  27.93 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  25.7 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2643  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.577807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>