More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1298 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  76.45 
 
 		 288 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  75.82 
 
 		 284 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  70.7 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  72.16 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  71.09 
 
 		 291 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  71.95 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  71.26 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  71.14 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  71.95 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  70 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  70 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  70 
 
 		 332 aa  361  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  69.92 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  69.51 
 
 		 276 aa  357  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  70.33 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  67.33 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  68.65 
 
 		 282 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  70.28 
 
 		 313 aa  345  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  69.41 
 
 		 286 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  67.69 
 
 		 287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  67.69 
 
 		 287 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  67.31 
 
 		 287 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  68.67 
 
 		 578 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  65.94 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  63.97 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  63.97 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  63.35 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  63.86 
 
 		 261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  61.75 
 
 		 256 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  62.1 
 
 		 271 aa  316  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  66.67 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  67.12 
 
 		 259 aa  314  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  63.71 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  65.85 
 
 		 276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  60.8 
 
 		 272 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.08 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  61.54 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  59.35 
 
 		 292 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 		 254 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  58.73 
 
 		 265 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  64.32 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  55.78 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  58.1 
 
 		 265 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 		 257 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.25 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  52.53 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.6 
 
 		 307 aa  208  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.87 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.73 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.17 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.06 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.17 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.17 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.81 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.74 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  50.9 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.22 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.14 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.51 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.52 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  45.81 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.7 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.39 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.96 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  52.06 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.61 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.24 
 
 		 259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.79 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.96 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.08 
 
 		 258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  42.45 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.63 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.25 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.95 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  40.46 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.25 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.22 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.33 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.55 
 
 		 254 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  46.58 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.18 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  44.4 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.87 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>