More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0504 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 402 aa  830    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  64.84 
 
 		 404 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  62.94 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  59.2 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  59.7 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  59.45 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  58.81 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  58.03 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  57.73 
 
 		 391 aa  461  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  58.03 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  61.31 
 
 		 404 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  56.74 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  56.99 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  56.74 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.61 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  55.72 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  57.96 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  58.12 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.87 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  56.12 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  57.44 
 
 		 384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  60.68 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  54.9 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  58.16 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  55.67 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  59.11 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  59.64 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  60.16 
 
 		 387 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  59.11 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  56.01 
 
 		 394 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  55.09 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  58.95 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  55.75 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  55.98 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  57.66 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  53.11 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  54.01 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  55.38 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  53.35 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  52.96 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  48.08 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.23 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  46.45 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.16 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  47.15 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  47.15 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  46.11 
 
 		 392 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.81 
 
 		 384 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  46.94 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  48.67 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.81 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  48.18 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  46.45 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  47.19 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 396 aa  352  1e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  45.95 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.42 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.33 
 
 		 398 aa  348  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.85 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.57 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.68 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.94 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.34 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.86 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0238  putative cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 393 aa  342  7e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  44.62 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0265  cysteine desulfurase, putative  46.72 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0291  cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 393 aa  340  4e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  45.75 
 
 		 401 aa  339  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  45.41 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  43.7 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.34 
 
 		 394 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.93 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.31 
 
 		 388 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.79 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  44.11 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  47.15 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  47.15 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45.43 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.19 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.15 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  44.84 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  47.15 
 
 		 403 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.76 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.04 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  44.22 
 
 		 398 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  44.88 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  47.12 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.5 
 
 		 403 aa  322  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  44 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.73 
 
 		 409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  44.08 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  43.47 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  44.7 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.24 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  44.56 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>