More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1424 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 241 aa  493  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  75.53 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  55.32 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  57.21 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  48.33 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  41.38 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  43.4 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  41.38 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  40 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  40.1 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  36.41 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  41.71 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  40.72 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  40.82 
 
 		 245 aa  141  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  34.76 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  41.01 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.87 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  39.8 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  37.88 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  36.65 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  36.26 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  36.59 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  36.98 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  37.59 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  27.4 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  36.47 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  30.19 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  36.81 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  37.68 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  31.77 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  36.5 
 
 		 189 aa  85.1  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  35.8 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  30.16 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  31.12 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.71 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  34.12 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  42.24 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  34.86 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  38.35 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.9 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.47 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.47 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  32.05 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  32.72 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  32.69 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  37.4 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  30.85 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  34.81 
 
 		 513 aa  75.5  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  32.18 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  31.07 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.85 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  30.81 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  34.95 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  30.23 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.29 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  38.69 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  32.64 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  26.9 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 		 293 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  27.84 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 		 280 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  37.17 
 
 		 516 aa  71.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  29.96 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  27.27 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  30.95 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  32.5 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  30.86 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  28.34 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  30.05 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  38.83 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  30.06 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  25.91 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0887  GMP synthase  32.86 
 
 		 519 aa  69.3  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  29.76 
 
 		 505 aa  69.3  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  37.25 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  29.24 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  31.33 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  25.91 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>