66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1982 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  45.66 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  27 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  29.41 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  26.18 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  28.41 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  27.03 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  28.47 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  28.98 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  29.27 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  25.17 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.89 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  24.88 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  27.46 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  31.67 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  29.31 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  28.57 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  26.5 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  23.6 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  26.02 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  25.51 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  23.86 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  24.29 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  26.46 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0998  pilus assembly protein, PilO  27.27 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0783  pilus assembly protein, PilO  31.71 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  26.92 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  25.84 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  22.51 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  25.88 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  27.1 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  29.27 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.214156 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  30.61 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  25.38 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  30.61 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  22.14 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  25.38 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  25.93 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  25 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0020  pilus assembly protein, PilO  26.13 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  26.09 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  25.16 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  26.59 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  25.15 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.47 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2718  fimbrial assembly protein PilO  25.85 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  24.83 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  29 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  21.39 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  24.85 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  29 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  31.58 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  26.67 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  28 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  31.58 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  27.78 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  27.78 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  28 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  25.56 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  30.95 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2171  pilus assembly protein, PilO  25.85 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21566  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  25.23 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  26.73 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  27.16 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2741  hypothetical protein  23.56 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.264504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>