More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0614 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  70.31 
 
 		 260 aa  351  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  61.9 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  57.09 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  56.97 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  58.5 
 
 		 270 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  58.5 
 
 		 270 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  56.52 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  57.54 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  58.1 
 
 		 270 aa  295  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 259 aa  294  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  54.58 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  51.66 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  52.03 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  55.6 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  56.22 
 
 		 256 aa  284  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  58.06 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  53.82 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.66 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  55.34 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  57.66 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  53.94 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  57.66 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  57.66 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  55.2 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  56.85 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  53.2 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  53.78 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  54.4 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  53.57 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  54.65 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  54.55 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  51.95 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  53.7 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  53.6 
 
 		 271 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  52.38 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 271 aa  275  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  53.67 
 
 		 262 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  51.18 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  56.4 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  56 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  53.2 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  54.98 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  56 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.99 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  56 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  55.73 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  52.17 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  53.57 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.98 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.97 
 
 		 286 aa  271  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  52.38 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  54.98 
 
 		 256 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  51.17 
 
 		 259 aa  271  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  52.21 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  53.28 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  52.87 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  58.87 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  52.34 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  52.38 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  54.18 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  52.78 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  55.02 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  53.78 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  57.66 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  51.56 
 
 		 256 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  55.82 
 
 		 333 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  53.6 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.55 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  54.18 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  55.78 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  54.18 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  51.2 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  51 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.26 
 
 		 257 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  57.26 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  53.41 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  53.41 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  51.18 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.95 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  53.82 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  53.44 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.95 
 
 		 307 aa  261  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  53.01 
 
 		 258 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>