More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0519 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  527  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  71.37 
 
 
255 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  70.59 
 
 
255 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2117  ABC transporter related  67.33 
 
 
251 aa  340  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  62.45 
 
 
258 aa  332  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  50.99 
 
 
259 aa  280  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  52.59 
 
 
256 aa  278  6e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.78 
 
 
255 aa  276  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  49.01 
 
 
255 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  51.39 
 
 
257 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  50.4 
 
 
263 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  49.8 
 
 
265 aa  261  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  50.79 
 
 
259 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  48.4 
 
 
256 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  49.6 
 
 
263 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  50 
 
 
252 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  49.21 
 
 
252 aa  259  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  48.64 
 
 
262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  47.78 
 
 
284 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  49 
 
 
265 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  47.41 
 
 
284 aa  258  9e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  48.8 
 
 
271 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  48.81 
 
 
270 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  46.72 
 
 
261 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.81 
 
 
270 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
259 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  48.81 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  49.2 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.43 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  50.2 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  47.81 
 
 
264 aa  251  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
255 aa  249  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.21 
 
 
286 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  47.86 
 
 
261 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  48.59 
 
 
271 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  48.44 
 
 
262 aa  247  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  47.04 
 
 
254 aa  246  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  46.4 
 
 
270 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
256 aa  245  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  45.53 
 
 
270 aa  244  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  46.27 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 
255 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
255 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.61 
 
 
256 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 
255 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  46.83 
 
 
257 aa  241  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
256 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  45.49 
 
 
273 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
255 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  45.05 
 
 
288 aa  239  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
255 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
257 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  46.56 
 
 
268 aa  238  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
256 aa  238  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  44.49 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  46.83 
 
 
273 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
260 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 
255 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  46.8 
 
 
257 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 
255 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 
251 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  44.62 
 
 
252 aa  235  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  46.22 
 
 
256 aa  235  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44.88 
 
 
255 aa  234  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.58 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  48.81 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  48.81 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 
255 aa  232  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  46 
 
 
257 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  45.6 
 
 
259 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0684  ABC transporter related protein  48.22 
 
 
255 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  44.62 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  45.56 
 
 
258 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  46.22 
 
 
257 aa  230  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.22 
 
 
259 aa  230  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 
258 aa  230  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 
260 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.16 
 
 
258 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  45.06 
 
 
261 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
258 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  43.25 
 
 
261 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  45.6 
 
 
255 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
271 aa  228  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  45.16 
 
 
258 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  45.16 
 
 
258 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  45.16 
 
 
258 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
255 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
255 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
255 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  44.49 
 
 
255 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
255 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>