More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0357 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  44.86 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.61 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 440 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  29.41 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 447 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 448 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.41 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.25 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.87 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  37.2 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.6 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 449 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 378 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  32.3 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.14 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.96 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.37 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.36 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.52 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  28.31 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 448 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  34.55 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.14 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.14 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  27.11 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.76 
 
 		 442 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.14 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.76 
 
 		 452 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 		 442 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>