More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3455 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  59.82 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  49.12 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  53.98 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  53.04 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2764  endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  54.24 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  54.24 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  54.39 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  51.33 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2227  Endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1932  Endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  49.12 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  49.06 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01767  hypothetical protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.712473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2023  endoribonuclease L-PSP family protein  46.49 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1966  endoribonuclease L-PSP family protein  46.49 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1962  endoribonuclease L-PSP family protein  46.49 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1494  endoribonuclease L-PSP family protein  46.49 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1309  endoribonuclease L-PSP family protein  46.49 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.264768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  47.79 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  46.55 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1162  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  44.74 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  47.41 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  48.25 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  47.41 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2814  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  43.48 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  45.38 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  49.09 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  47.41 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  43.86 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  49.14 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 117 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  41.03 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  45.61 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  45.61 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  45.61 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  45.61 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  48.18 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  43.86 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2814  Endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.742637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>