More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5638 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5252  LysR family transcriptional regulator  84.38 
 
 		 295 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3530  LysR family transcriptional regulator  82.19 
 
 		 296 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  73.13 
 
 		 300 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  73.26 
 
 		 300 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  70.07 
 
 		 300 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  67 
 
 		 300 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 303 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4510  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172827  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 334 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.2 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4138  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3066  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  37.1 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 415 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  38.72 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>