More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4690 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  100 
 
 
364 aa  741    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  64.36 
 
 
370 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.17 
 
 
370 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  59.32 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  59.48 
 
 
376 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  62.14 
 
 
380 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  57.91 
 
 
374 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  59.88 
 
 
350 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  51.22 
 
 
300 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  51.2 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  47.73 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00231  GTPase  47.14 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  42.9 
 
 
313 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  41.69 
 
 
312 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  41.69 
 
 
312 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.54 
 
 
294 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.28 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00181  GTPases  32.12 
 
 
305 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.6 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.64 
 
 
292 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  42.28 
 
 
290 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  32.75 
 
 
305 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  30.94 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  36.61 
 
 
293 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  36.61 
 
 
293 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  36.61 
 
 
293 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 
293 aa  175  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  31.79 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.22 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.03 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.86 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.33 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  41.2 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  35.59 
 
 
293 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.61 
 
 
319 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 
305 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  39.41 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.53 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.67 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.02 
 
 
295 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.02 
 
 
293 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 
319 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
287 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
287 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.38 
 
 
294 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.32 
 
 
291 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 
290 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  35.15 
 
 
290 aa  152  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.21 
 
 
282 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.13 
 
 
288 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.07 
 
 
352 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.12 
 
 
300 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.22 
 
 
302 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.53 
 
 
288 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  39.71 
 
 
343 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  34.96 
 
 
311 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.72 
 
 
337 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 
343 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 
343 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.89 
 
 
343 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 
343 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  33.22 
 
 
294 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.04 
 
 
352 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.02 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.63 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.92 
 
 
354 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  38.18 
 
 
343 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.96 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  37.86 
 
 
299 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  30.62 
 
 
325 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  33.92 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.1 
 
 
308 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  34.27 
 
 
353 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 
344 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  34.62 
 
 
354 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  33.93 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  33.93 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.01 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33.93 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  33.93 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.64 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  34.43 
 
 
295 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.94 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.08 
 
 
296 aa  133  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  40.72 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  35.27 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 
354 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  40.31 
 
 
331 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>