More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4625 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  68.86 
 
 		 446 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 444 aa  912    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  66.67 
 
 		 453 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.98 
 
 		 446 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.89 
 
 		 446 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.89 
 
 		 446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  63.41 
 
 		 446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  51.03 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14411  putative modulator of DNA gyrase  49.21 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  50.92 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  49.08 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  47.09 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10271  putative modulator of DNA gyrase  44 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.229888  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10261  putative modulator of DNA gyrase  44.22 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0958  putative modulator of DNA gyrase  44.3 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09181  putative modulator of DNA gyrase  45.08 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  46.94 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  29.28 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  28.44 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.91 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.82 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.3 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.59 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.35 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.7 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.69 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.47 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.65 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  26.28 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  27.04 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.11 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.14 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.23 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 		 470 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  30.71 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  28.46 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.77 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.68 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  30.09 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.84 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.05 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.72 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  28.63 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.54 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 		 465 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.85 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  23.17 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.17 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.95 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.31 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  26.8 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.56 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  26.17 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.22 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.01 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.49 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  28.57 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.15 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  23.5 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.07 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.13 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.29 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0473  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0351286  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  25.29 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.31 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.79 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.28 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  24.12 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.18 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  24.58 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  23.26 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  23.26 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  23.26 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  23.26 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  23.26 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  23.26 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  24.06 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  22.67 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  24.47 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.76 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  23.02 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.73 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.38 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  24.4 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  24.31 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.64 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  22.78 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.51 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.16 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.82 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.93 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.04 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>