54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3180 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  49.04 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  49.52 
 
 
311 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  45.39 
 
 
281 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  44.66 
 
 
312 aa  255  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  44.63 
 
 
280 aa  249  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  49.5 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  37.5 
 
 
266 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  32.67 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  35.56 
 
 
233 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  33.67 
 
 
282 aa  122  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  31.56 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  44.63 
 
 
119 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  31.8 
 
 
284 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  30.18 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  28.68 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  38.33 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  38.33 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  35.04 
 
 
246 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  36.89 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  38.14 
 
 
152 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  40.62 
 
 
130 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  31.62 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  43.21 
 
 
123 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  36.11 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  25.77 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  37.88 
 
 
131 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  35.37 
 
 
243 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  32.52 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  32.56 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  32.23 
 
 
258 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  27.03 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  32.43 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  32.43 
 
 
277 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  27.8 
 
 
301 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  29.03 
 
 
249 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4280  hypothetical protein  28.57 
 
 
111 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  33.75 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.29 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  34.67 
 
 
158 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2036  photosynthetic reaction center H subunit  29.35 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  30.49 
 
 
160 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  30.49 
 
 
160 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1879  hypothetical protein  43.48 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  30.49 
 
 
161 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  29.29 
 
 
120 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  28.68 
 
 
259 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  28.68 
 
 
259 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  30.43 
 
 
189 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.576024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>