More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2040 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  249  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  43.82 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  45.78 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 305 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 307 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  39.68 
 
 		 306 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  37.8 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  44.29 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  39.51 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  39.24 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.35 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  42.25 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  34.44 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 328 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 337 aa  57.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>