140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1837 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1837  glutamate/cysteine ligase  100 
 
 
382 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814735  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  68.53 
 
 
380 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  67.8 
 
 
379 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  68.27 
 
 
380 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  69.6 
 
 
379 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  65.62 
 
 
384 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  67.74 
 
 
384 aa  511  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  65 
 
 
383 aa  511  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22731  hypothetical protein  55.59 
 
 
380 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1148  hypothetical protein  52.02 
 
 
379 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1932  glutamate--cysteine ligase, putative  54.97 
 
 
380 aa  388  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916943  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20221  hypothetical protein  52.02 
 
 
379 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.574897  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16961  hypothetical protein  53.28 
 
 
378 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0397  glutamate--cysteine ligase, putative  54.93 
 
 
386 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17631  hypothetical protein  47.27 
 
 
372 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17671  hypothetical protein  46.32 
 
 
372 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17831  hypothetical protein  46.59 
 
 
369 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1668  hypothetical protein  44.69 
 
 
372 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.589825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  24.63 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.7 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.67 
 
 
401 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  25.8 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  25 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.3 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  24.44 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.03 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  24.43 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  26.38 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  24.25 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  24.17 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  27.05 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.8 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  28.91 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  28 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  27.51 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  27.56 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  27.56 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  27.56 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  26.59 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  26.81 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  25.28 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  27.27 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  23.14 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.7 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  26.44 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  27.85 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.65 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  26.77 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  25.58 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.56 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.29 
 
 
378 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  25.87 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.87 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.43 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.22 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.99 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.9 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.78 
 
 
372 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  22.95 
 
 
861 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  23.9 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  24.29 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  27.23 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  24.4 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  26.94 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.08 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  22.63 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  28.68 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.14 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  25.16 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  22.35 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  25.36 
 
 
865 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.9 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.1 
 
 
392 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  27.66 
 
 
365 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.14 
 
 
375 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.02 
 
 
374 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  25.91 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  27.27 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.9 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.2 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  23.97 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  22.73 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  22.73 
 
 
377 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  23.89 
 
 
423 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  22.73 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  23.26 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  23.26 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  23.26 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  24.44 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  23.26 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  24.91 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.24 
 
 
375 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.24 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  26.35 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  23.13 
 
 
371 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  23.13 
 
 
371 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.03 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.1 
 
 
379 aa  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.67 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  22.32 
 
 
837 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>