More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2360 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
552 aa  1097    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.66 
 
 
506 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.66 
 
 
506 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.66 
 
 
506 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.4 
 
 
523 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  50.65 
 
 
510 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  53.23 
 
 
510 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  51.93 
 
 
524 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  53.08 
 
 
489 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.31 
 
 
507 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.21 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  48.53 
 
 
523 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  51.3 
 
 
508 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.22 
 
 
526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.37 
 
 
546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.41 
 
 
510 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  47.5 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.54 
 
 
528 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.47 
 
 
477 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 
483 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 
483 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.72 
 
 
483 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 
522 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
478 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  47.08 
 
 
511 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 
533 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.3 
 
 
490 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  41.87 
 
 
543 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 
545 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  35.57 
 
 
552 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 
552 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  35.48 
 
 
550 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  34.64 
 
 
544 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 
549 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 
549 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  35.91 
 
 
576 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  36.11 
 
 
570 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.22 
 
 
579 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  35.12 
 
 
578 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  34.08 
 
 
552 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 
549 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  36.98 
 
 
557 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  34.1 
 
 
548 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  37.2 
 
 
562 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 
560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  35.49 
 
 
549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  36.51 
 
 
578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 
562 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  34.64 
 
 
560 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 
560 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  36.42 
 
 
562 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
553 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  36.33 
 
 
578 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  36.04 
 
 
557 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  33.57 
 
 
579 aa  301  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 
548 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 
1043 aa  300  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 
843 aa  300  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  35.97 
 
 
557 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  35.7 
 
 
560 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  34.01 
 
 
549 aa  299  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  35.45 
 
 
518 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 
547 aa  297  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
558 aa  297  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.28 
 
 
514 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  36.69 
 
 
579 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  36.9 
 
 
577 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
558 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  38.49 
 
 
549 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  37.07 
 
 
572 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 
561 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  36.46 
 
 
572 aa  293  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  36.6 
 
 
543 aa  293  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
550 aa  293  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  36.33 
 
 
561 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.76 
 
 
587 aa  293  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
566 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  35.36 
 
 
560 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 
575 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 
571 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 
566 aa  289  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.39 
 
 
576 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  34.45 
 
 
573 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  36.01 
 
 
540 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
554 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
662 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  35.92 
 
 
574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  37.45 
 
 
538 aa  287  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.78 
 
 
828 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  37.02 
 
 
540 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  37.02 
 
 
540 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.28 
 
 
503 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.94 
 
 
564 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  33.7 
 
 
571 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  34.07 
 
 
571 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 
542 aa  286  9e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  35.27 
 
 
577 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  34.13 
 
 
576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 
564 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>