83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2718 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 80 aa  159  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  48.57 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  38.96 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  42.65 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  32.88 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  31.65 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  39.62 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  35.62 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  30.56 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  34.69 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.55 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  29.58 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  37.31 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  27.03 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  39.06 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.8 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  30.14 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  31.65 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  29.58 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  29.58 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  31.03 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  32.84 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  29.11 
 
 		 81 aa  43.5  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  35.56 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  37.68 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  30.61 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.71 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  30.65 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  31.37 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  34.88 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  32.61 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  29.03 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  31.37 
 
 		 127 aa  42  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  32.69 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 		 158 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  29.09 
 
 		 125 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3658  preprotein translocase subunit SecE  25 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000015215  hitchhiker  0.000000741444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  30.51 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0300  preprotein translocase subunit SecE  26.15 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  30.36 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  32.61 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  29.55 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.61 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  29.55 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  32 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  29.33 
 
 		 84 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2183  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 162 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0165979  decreased coverage  0.00917802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  36.17 
 
 		 60 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  40.98 
 
 		 72 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 157 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1893  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 162 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0127051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>