More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2892 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
242 aa  490  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  57.4 
 
 
225 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  57.99 
 
 
226 aa  245  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  51.57 
 
 
230 aa  232  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  48.46 
 
 
233 aa  226  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  50.45 
 
 
229 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  54.59 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  52.04 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  50.67 
 
 
229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  52.27 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  50.44 
 
 
234 aa  214  8e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  50.45 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  54.97 
 
 
242 aa  188  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  52.08 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  51.05 
 
 
243 aa  181  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  50.79 
 
 
259 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
251 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 
243 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  47.4 
 
 
237 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  52.38 
 
 
239 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  52.43 
 
 
269 aa  174  8e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  45.83 
 
 
276 aa  174  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  53.4 
 
 
246 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  44.87 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  53.4 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  50.77 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  51.34 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  52.11 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  52.88 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  48.99 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  48.48 
 
 
278 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  46.52 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  48.48 
 
 
278 aa  171  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  47.94 
 
 
235 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  50.77 
 
 
273 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  51.83 
 
 
239 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  52.11 
 
 
243 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  50.53 
 
 
233 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  48.97 
 
 
278 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  52.11 
 
 
243 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 
273 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 
273 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 
273 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  44.63 
 
 
276 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 
273 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 
273 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  52.63 
 
 
243 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  51.05 
 
 
244 aa  168  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  47.59 
 
 
251 aa  168  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  52.11 
 
 
243 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  54.5 
 
 
232 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  44.07 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  44.07 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  50.27 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 
246 aa  165  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  49.74 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  50.79 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  50.79 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  47.69 
 
 
254 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  49.21 
 
 
241 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 
237 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  49.45 
 
 
245 aa  159  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  47.37 
 
 
248 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  47.8 
 
 
241 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  41.6 
 
 
246 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  50.26 
 
 
253 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  48.08 
 
 
234 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  44.16 
 
 
233 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  42.79 
 
 
230 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  44.84 
 
 
241 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 
264 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 
276 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  38.77 
 
 
242 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  46.99 
 
 
248 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  44.5 
 
 
249 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1487  Silent information regulator protein Sir2  42.29 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.72672  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  44.5 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  43.85 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1071  NAD-dependent deacetylase  43.32 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.202923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  41.95 
 
 
273 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1194  NAD-dependent deacetylase  42.33 
 
 
233 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0597441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  45.6 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  39.33 
 
 
237 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  47.03 
 
 
244 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  42.72 
 
 
265 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  44.85 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  43.81 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1453  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0321606  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  43.46 
 
 
244 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  43.37 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  41.71 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  38.24 
 
 
245 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>