More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2762 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  57.76 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  59.32 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  57.98 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  58.47 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  58.62 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  58.62 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 		 115 aa  133  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  58.12 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  56.52 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  55.46 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  54.31 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  52.14 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  56.03 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 		 117 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  46.55 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  49.57 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  47.86 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  47.86 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  45.61 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  45.61 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  47.86 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  45.76 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  45.76 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  46.15 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  46.15 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  46.15 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  46.15 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01767  hypothetical protein  46.15 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.712473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  46.15 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  46.15 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  46.55 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  44.07 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.06 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  44.35 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  42.37 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  43.97 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2764  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1932  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2227  Endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  43.1 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>