More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0137 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  851    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  54.21 
 
 		 420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  27.07 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  26.83 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  26.83 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  26.34 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3970  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3157  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  27.9 
 
 		 411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0967  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.43 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.58 
 
 		 446 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 435 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.13 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.19 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25.59 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 460 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.39 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 469 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  24.76 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.06 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  26.55 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  25.29 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.21 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  24.22 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  26.09 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  25.29 
 
 		 454 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  25.29 
 
 		 454 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  25.73 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  25.6 
 
 		 461 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 441 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  26.47 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  25.91 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  25.78 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  25.91 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  26.51 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  24.42 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  24.42 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  24.42 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  24.42 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  24.42 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  24.23 
 
 		 440 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 449 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25 
 
 		 448 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  23.46 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  24.01 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.56 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  27.8 
 
 		 438 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 449 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  24.88 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>