84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4923 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 460 aa  960    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  56.14 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  54.17 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  53.88 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  43.27 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  29.96 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  28.6 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  28.7 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  30.07 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  29 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  28.28 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  30.65 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  29.65 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  29.49 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  28.52 
 
 		 515 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  23.89 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  25.19 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  24.73 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.64 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  24.37 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  24.37 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.37 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  24.37 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  24.73 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  24.73 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  24.73 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  24.73 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  24.73 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  24.73 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  24.73 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  24.36 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  25.25 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  21.97 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.14 
 
 		 518 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.39 
 
 		 496 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  22.17 
 
 		 500 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  22.63 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  26.84 
 
 		 489 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  24.4 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  21.76 
 
 		 489 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  23.86 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  23.4 
 
 		 509 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2407  carbohydrate kinase, FGGY  23.08 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.242819  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  22.92 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  21.86 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  25.13 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  22.59 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  22.71 
 
 		 520 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  22.07 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  25.39 
 
 		 502 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  23.56 
 
 		 524 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  26.6 
 
 		 518 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  23.79 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  24.06 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  25.39 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  23.67 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  22.7 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  22.7 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  22.7 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  22.7 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  22.7 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  24.61 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  24.25 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  22.7 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  24.61 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  22.38 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  22.37 
 
 		 526 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  23.18 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  24.25 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  24.06 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  24.06 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  25 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  25.23 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  23.63 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  24.48 
 
 		 494 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  23.4 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  23.44 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  21.57 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  26.61 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  22.43 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.33 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  23.74 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  22.61 
 
 		 499 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  23.42 
 
 		 473 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>