More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4287 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  42.61 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  47.47 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  48.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  48.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  45 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  53.26 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  44 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  46 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  46.88 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  48.94 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  48.94 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  48.91 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  51.25 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  47.92 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  47.92 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 106 aa  91.7  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40.2 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  48.96 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  48.94 
 
 		 119 aa  90.5  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 117 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 117 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 117 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 108 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  48.24 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  52.22 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  52.22 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  46.88 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  46.88 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  44.94 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.79 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  44.94 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  46.32 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>