126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1566 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1499  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  48.23 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2142  hypothetical protein  51.94 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.89 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5570  hypothetical protein  45.98 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.492246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  47.32 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67039  predicted protein  38.74 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.147925 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03681  Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, putative (Eurofung)  40.32 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0906032  normal  0.0956123 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04990  Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, putative (Eurofung)  36.21 
 
 		 288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.267211 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04690  membrane fraction protein, putative  33.87 
 
 		 383 aa  124  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  32.24 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  29.55 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  30.09 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.84 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  29.46 
 
 		 374 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  30.7 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  30.7 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  29.61 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  34.74 
 
 		 274 aa  99.8  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  28.31 
 
 		 357 aa  98.2  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  29.34 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  29.09 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  29.95 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  26.7 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  30.53 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.23 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  28.77 
 
 		 280 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  29.31 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  29.78 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.27 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.63 
 
 		 376 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  29.86 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.55 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  27.91 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  27.91 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  27.75 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  30.72 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  28.9 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.7 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.6 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  26.2 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.61 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.55 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  29.06 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  25.78 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  23.94 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  25.78 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  25.78 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  29.35 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  22.91 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  29.25 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  28.83 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  27.59 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.15 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  22.69 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  28.7 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  22.47 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  26.27 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  27.19 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  23.85 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  27.04 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  26.29 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  29.95 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  27.31 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  27.73 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.27 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.68 
 
 		 371 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.39 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  25.69 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.31 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  25.11 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1636  hypothetical protein  25.14 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  hitchhiker  0.00000056751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.77 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  27.43 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  21.66 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  29.03 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.23 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.57 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.34 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  25.91 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  20.44 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  25 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  20.91 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  20.91 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.83 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  27.83 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  27.59 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.67 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  26.04 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  22.57 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  25.88 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43313  predicted protein  26.06 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  22.15 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  26.46 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  24.53 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5187  hypothetical protein  28.74 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>