122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3418 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5570  hypothetical protein  80.09 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.492246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2142  hypothetical protein  71.43 
 
 		 231 aa  316  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  63.16 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.43 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1499  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.22 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.95 
 
 		 227 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67039  predicted protein  40.64 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.147925 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03681  Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, putative (Eurofung)  39.3 
 
 		 300 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0906032  normal  0.0956123 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04990  Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, putative (Eurofung)  37.95 
 
 		 288 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.267211 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04690  membrane fraction protein, putative  36.36 
 
 		 383 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  31.78 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  32.06 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  30.17 
 
 		 376 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  27.23 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  26.76 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  26.64 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  30.63 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  30.63 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  29.03 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  32.37 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  29.09 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  30.84 
 
 		 343 aa  91.7  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  28.51 
 
 		 374 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  30.28 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.36 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  33.51 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  34.81 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  31.36 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  26.55 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  30.1 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1636  hypothetical protein  29.94 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  hitchhiker  0.00000056751 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.46 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  31.49 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.23 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  27.63 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  30.04 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.13 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.96 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  29.22 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  29.95 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.14 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.14 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.88 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  29.34 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  28.83 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  31.4 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43313  predicted protein  26.5 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.32 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.63 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.26 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.75 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  26.94 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  26.99 
 
 		 368 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  28.44 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  30.06 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  28.95 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.23 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  31.05 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  26.64 
 
 		 365 aa  65.5  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.97 
 
 		 371 aa  65.1  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  27.04 
 
 		 374 aa  65.1  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.58 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.84 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43314  predicted protein  24.77 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.05 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  24.22 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  25.86 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  28.22 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  28.76 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  28.18 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  27.95 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  23.04 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  24.51 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  28.16 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.52 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  27.31 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  27.43 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.38 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  27.83 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  28.79 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  23.61 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.62 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  28.89 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  26.96 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  34.91 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.58 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.91 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  34.91 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  28.78 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.09 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  31.48 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.22 
 
 		 401 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.67 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>