143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2425 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  72.53 
 
 
233 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  71.24 
 
 
233 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  67.97 
 
 
231 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  68.54 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  66.67 
 
 
228 aa  281  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  69.91 
 
 
233 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  66.52 
 
 
233 aa  265  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  67.69 
 
 
232 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  67.4 
 
 
233 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  65.04 
 
 
230 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  70.82 
 
 
231 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  68.4 
 
 
231 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  64.91 
 
 
235 aa  251  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  65.57 
 
 
231 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  70.39 
 
 
231 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  67.26 
 
 
230 aa  244  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  60.09 
 
 
233 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  56.58 
 
 
242 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  59.47 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  60.35 
 
 
231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  57.71 
 
 
239 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.23 
 
 
234 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  225  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  65.96 
 
 
235 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  59.83 
 
 
235 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  59.39 
 
 
235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  50.66 
 
 
233 aa  221  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.82 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  63.16 
 
 
229 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  59.47 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  62.34 
 
 
231 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  57.52 
 
 
235 aa  201  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  56.44 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  54.5 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  51.11 
 
 
233 aa  192  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  52 
 
 
233 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  64.45 
 
 
211 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.26 
 
 
246 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.74 
 
 
238 aa  184  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  53.85 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  57.96 
 
 
234 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  56.02 
 
 
190 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.2 
 
 
229 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.68 
 
 
242 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  54.02 
 
 
230 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.02 
 
 
230 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  51.11 
 
 
241 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  45.28 
 
 
232 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5187  hypothetical protein  56.11 
 
 
166 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  60.4 
 
 
160 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  35.78 
 
 
227 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  43.15 
 
 
245 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  43.1 
 
 
243 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  42.99 
 
 
357 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  35.96 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  46.76 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  33.04 
 
 
229 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.55 
 
 
240 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  34.53 
 
 
227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  41.26 
 
 
376 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  35 
 
 
226 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.51 
 
 
235 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  31.48 
 
 
226 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.94 
 
 
265 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  34.22 
 
 
230 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  49.36 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  49.44 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.68 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  42.67 
 
 
374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  41.9 
 
 
270 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  44.08 
 
 
237 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  40.27 
 
 
372 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  33.04 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  46.29 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  31.08 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  31.08 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  43.45 
 
 
237 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.32 
 
 
254 aa  111  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.37 
 
 
372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.37 
 
 
372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  38.98 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.51 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.78 
 
 
376 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  39.07 
 
 
250 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  38.81 
 
 
371 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  35.27 
 
 
244 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.56 
 
 
235 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  30.4 
 
 
227 aa  99  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  30.4 
 
 
227 aa  99  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.67 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.77 
 
 
371 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  46.36 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  54.37 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.48 
 
 
396 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  37.39 
 
 
368 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  33.77 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>