156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1618 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  88.56 
 
 
376 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  72.34 
 
 
374 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  63.22 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52.14 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.96 
 
 
372 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.69 
 
 
372 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  59.01 
 
 
250 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  44.41 
 
 
372 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  41.91 
 
 
371 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  41.55 
 
 
343 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  36.15 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.81 
 
 
396 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  36.91 
 
 
387 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  36.53 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  33.85 
 
 
376 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.33 
 
 
360 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.66 
 
 
401 aa  156  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  42.98 
 
 
249 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.3 
 
 
265 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  36.12 
 
 
383 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  46.73 
 
 
239 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.95 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.86 
 
 
233 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  46.47 
 
 
237 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.11 
 
 
399 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.48 
 
 
235 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  37.84 
 
 
245 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  37.84 
 
 
245 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  37.84 
 
 
245 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  45.89 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.81 
 
 
246 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  37.56 
 
 
232 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  39.91 
 
 
245 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.25 
 
 
238 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  38.74 
 
 
244 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  42.01 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  36.99 
 
 
229 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.17 
 
 
238 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.3 
 
 
242 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  41.28 
 
 
233 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  41.56 
 
 
237 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.64 
 
 
235 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  40.55 
 
 
235 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  37.9 
 
 
242 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  40.83 
 
 
235 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.73 
 
 
234 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  39.27 
 
 
231 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  37.61 
 
 
231 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  41.96 
 
 
239 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  37.9 
 
 
233 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  41.1 
 
 
230 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.56 
 
 
236 aa  116  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  35.62 
 
 
233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  38.53 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  35.91 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  38.53 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.45 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  38.81 
 
 
233 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  39.73 
 
 
235 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  31.02 
 
 
227 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.71 
 
 
231 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  39.29 
 
 
235 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  37.16 
 
 
233 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  38.07 
 
 
230 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.69 
 
 
241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  40.91 
 
 
229 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  37.16 
 
 
233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  38.46 
 
 
237 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  33.94 
 
 
227 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  44.08 
 
 
231 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  38.81 
 
 
240 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  29.87 
 
 
274 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  38.92 
 
 
263 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  37.61 
 
 
233 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.45 
 
 
229 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  38.99 
 
 
231 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  49.19 
 
 
229 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  30.17 
 
 
231 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  38.81 
 
 
243 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  36.82 
 
 
228 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  38.53 
 
 
231 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.53 
 
 
231 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  42.27 
 
 
235 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.36 
 
 
240 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  32.88 
 
 
226 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  27.96 
 
 
215 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.201288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.1 
 
 
247 aa  99.4  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.93 
 
 
227 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  30.29 
 
 
247 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  38.53 
 
 
231 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  27.7 
 
 
241 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  32.29 
 
 
228 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  27.19 
 
 
241 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  38.53 
 
 
234 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  32.27 
 
 
250 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  32.27 
 
 
250 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.27 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  28.44 
 
 
236 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  37.43 
 
 
190 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>