159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4424 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  733    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  68.93 
 
 
396 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  63.47 
 
 
387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  62.77 
 
 
365 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  66.14 
 
 
399 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  62.53 
 
 
389 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  64.5 
 
 
360 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  62.05 
 
 
401 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  56.6 
 
 
376 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  58.97 
 
 
383 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  36.15 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  36.77 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.45 
 
 
376 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  38.98 
 
 
372 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.69 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.48 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  36.75 
 
 
371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.1 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  34.99 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  37.93 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  39.91 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.16 
 
 
235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.35 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.74 
 
 
235 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  38.37 
 
 
245 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.29 
 
 
233 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  41.82 
 
 
237 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  38.5 
 
 
245 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  38.5 
 
 
245 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  38.5 
 
 
245 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.78 
 
 
246 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  39.11 
 
 
231 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  41.1 
 
 
239 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.33 
 
 
236 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  42.41 
 
 
237 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  34.51 
 
 
229 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.26 
 
 
231 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  37.34 
 
 
244 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  38.16 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.11 
 
 
234 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  39.64 
 
 
228 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.14 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  35.65 
 
 
232 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  33.8 
 
 
227 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.6 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  34.07 
 
 
242 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  37.27 
 
 
233 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  52.43 
 
 
233 aa  89.7  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.25 
 
 
242 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  37.99 
 
 
233 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.7 
 
 
361 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  41.35 
 
 
235 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  40.09 
 
 
230 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.82 
 
 
238 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  25.56 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.82 
 
 
238 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  40.18 
 
 
239 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  34.35 
 
 
233 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  36.68 
 
 
233 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  37.1 
 
 
270 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  36.89 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.94 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  47.22 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  36.48 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  41.73 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  47.22 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  31.86 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  47.22 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  38.24 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  30.14 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43314  predicted protein  33.19 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  37.5 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  50.52 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  50.52 
 
 
231 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  37.11 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.48 
 
 
231 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  46.88 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.58 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  36.08 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  26.36 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43313  predicted protein  29.39 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  36.89 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  30.84 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.79 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  25.77 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  32.92 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  28.64 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  44.33 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.64 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.84 
 
 
229 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  24.5 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  32.57 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  29.95 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  29.95 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  29.58 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.2 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  26.63 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  27.69 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>